Recuperación parcial de microbiomas después del tratamiento antibiótico

Los antibióticos afectan profundamente al microbioma intestinal y modulan las comunidades microbianas. Recientemente, observamos que los fármacos antimicrobianos también impactan la abundancia y distribución de los genes de resistencia a los antibióticos. En este apéndice, reconsideramos nuestro conjunto de datos metagenómicos de aproximadamente 1 billón de nucleótidos para cuantificar diferencias genómicas exhaustivas a nivel de secuencia antes y después del tratamiento antibiótico. Mostramos que la exposición de 7 días a cefprozil conduce a una pérdida estadísticamente significativa de secuencias de metagenoma. La recuperación de los microbiomas intestinales 3 meses después de la antibioterapia se caracterizó por la aparición de nuevas secuencias genómicas no observadas antes de la exposición a antibióticos. Los participantes con baja diversidad inicial del microbioma intestinal mostraron un aumento en la cantidad de secuencias relacionadas con la resistencia a antibióticos. Por lo tanto, sugerimos que, si bien la composición taxonómica de los microbiomas se ve parcialmente afectada por el antibiótico, el contenido genómico y la estructura poblacional de las comunidades bacterianas están notablemente impactados.