Estructura Poblacional y Eigenanálisis

Los métodos actuales para inferir la estructura poblacional a partir de datos genéticos no proporcionan pruebas de significancia formal para la diferenciación poblacional. Discutimos un enfoque para estudiar la estructura poblacional (análisis de componentes principales) que fue aplicado por primera vez a datos genéticos por Cavalli-Sforza y colegas. Colocamos el método sobre una base estadística sólida, utilizando resultados de la estadística moderna para desarrollar pruebas de significancia formal. También descubrimos un fenómeno general de ''cambio de fase'' sobre la capacidad de detectar estructura en datos genéticos, que surge de la teoría estadística que utilizamos, y tiene una importante implicación para la capacidad de descubrir estructura en datos genéticos: para un tamaño de conjunto de datos fijo pero grande, la divergencia entre dos poblaciones (medida, por ejemplo, por una estadística como F ST) por debajo de un umbral es esencialmente indetectable, pero un poco por encima del umbral, la detección será fácil. Esto significa que podemos predecir el tamaño del conjunto de datos necesario para detectar estructura.