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La alineación múltiple de secuencias de ADN es un paso importante en varios análisis biológicos moleculares. A medida que se dispone de una gran cantidad de datos de secuencias a través de proyectos de secuenciación del genoma y otros proyectos a gran escala, se requiere actualmente escalabilidad, así como precisión, para un programa de alineación de secuencias múltiples (MSA). En este capítulo, describimos los algoritmos de un programa de MSA MAFFT y proporcionamos consejos prácticos, centrándonos en varias situaciones típicas que un biólogo enfrenta a veces. Para la alineación del genoma, que está más allá del alcance de MAFFT, introducimos dos herramientas: TBA y MAUVE.
Katoh et al. (Jue,) estudiaron esta cuestión.