Eventos iniciales en la iniciación de la transcripción bacteriana

La iniciación de la transcripción es un paso altamente regulado de la expresión génica. Aquí, discutimos la serie de grandes cambios conformacionales desencadenados por la unión específica inicial de la ARN polimerasa bacteriana (RNAP) al ADN del promotor y su relevancia para la regulación. La flexión y el envolvimiento del dúplex aguas arriba facilitan la flexión del dúplex aguas abajo hacia el espacio activo, nucleando la apertura de 13 pb en la hendidura. El paso de apertura que determina la velocidad, impulsado por la energía libre de unión, forma un complejo abierto inestable, probablemente con la cadena molde en el sitio activo. En algunos promotores, este complejo abierto inicial se estabiliza significativamente por reordenamientos de la región discriminadora entre el elemento -10 y la base +1 de la cadena no molde y elementos móviles en la hendidura y aguas abajo de la RNAP. La tasa de formación del complejo abierto se regula por efectos en los pasos rápidamente reversibles que preceden a la apertura del ADN, mientras que la duración del complejo abierto se regula por efectos en la estabilización del complejo abierto inicial. La apertura y cierre intrínsecos del ADN parecen estar menos regulados. Este mecanismo no covalente y su regulación exhiben muchas analogías con los mecanismos de catálisis enzimática.