Cuantificación de grupos bacterianos dentro de la flora fecal humana mediante hibridación con sondas de oligonucleótidos

Para investigar la estructura poblacional de los grupos filogenéticos predominantes dentro de la microbiota fecal humana adulta, se diseñó, validó y utilizó una nueva sonda de oligonucleótido designada S-G-Clept-1240-a-A-18 junto con un conjunto de cinco sondas de oligonucleótidos dirigidas al ARN ribosómico 16S. La aplicación de las seis sondas a muestras fecales de 27 adultos humanos mostró una aditividad del 70% del total de ARN ribosómico 16S detectado por la sonda de dominio bacteriano. La sonda específica del grupo Bacteroides representó el 37% +/- 16% del ARN ribosómico total, mientras que la sonda del grupo entérico representó menos del 1%. Las sondas específicas del subgrupo Clostridium leptum y del grupo Clostridium coccoides representaron el 16% +/- 7% y el 14% +/- 6%, respectivamente, mientras que los grupos Bifidobacterium y Lactobacillus constituyeron menos del 2%.