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El análisis metabolómico de fluidos corporales así como de células depende de muchos factores. Aunque existen varios procedimientos operativos estándar bien aceptados para el análisis de fluidos corporales, el análisis cuantitativo basado en NMR de metabolitos celulares está menos estandarizado. Los diseños experimentales dependen del tipo de célula, del protocolo de inhibición y del flujo de trabajo post-adquisición aplicado. Aquí, ofrecemos un tutorial para la descripción cuantitativa del fenotipo metabólico de células de mamíferos utilizando espectroscopía NMR. Discutimos todos los pasos clave del proceso, comenzando desde la selección del medio de cultivo apropiado, técnicas de inhibición para detener el metabolismo de manera reproducible, la extracción de los componentes intracelulares y el perfilado del medio de cultivo. También se proporciona la adquisición de datos NMR y métodos para análisis cualitativos y cuantitativos. Los métodos sugeridos abarcan experimentos para células adherentes y células en suspensión. Finalmente, describimos la aplicación del flujo de trabajo discutido a una línea celular de cáncer de tiroides. Aunque este tutorial se centra en células de mamíferos, las guías y procedimientos dados pueden ajustarse para el análisis de otros tipos de células.
Kostidis et al. (Wed,) estudiaron esta cuestión.