Hacia una Selección Genómica Práctica de Embriones en Ganado: Un Flujo de Trabajo Optimizado que Permite la Predicción de Valores Genéticos con Alta Precisión sin Comprometer la Supervivencia Embrionaria

La implementación de la selección genómica embrionaria (EGS) está limitada por la falta de un flujo de trabajo estandarizado que equilibre una alta precisión en la genotipificación con la preservación de la viabilidad embrionaria, especialmente debido a la heterogeneidad embrionaria. Para abordar esto, optimizamos sistemáticamente los pasos críticos de la biopsia del trofectodermo y la amplificación del genoma completo, estableciendo una estrategia estratificada por diámetro que vincula el diámetro del embrión con un rango de área de biopsia diseñado para proteger la recuperación embrionaria mientras se asegura una cantidad suficiente de ADN para una genotipificación confiable. Nuestros resultados mostraron una alta concordancia (> 98%) entre los valores genómicos estimados de cría (GEBVs) del embrión y del ternero, respaldando la fiabilidad de las predicciones. De manera crucial, definimos un marco de biopsia basado en el diámetro: para embriones < 150 μm se apoyó una área máxima de 600 μm2 para mantener la viabilidad, mientras que embriones más grandes (≥ 150 μm) toleraron hasta 1500 μm2, con un umbral mínimo de 840 μm2 garantizando > 90% de tasas de llamado de genotipos. Al prevenir el sobremuestreo en embriones pequeños y el submuestreo en diferentes tamaños embrionarios, este control guiado por diámetro mejora tanto la supervivencia embrionaria como la precisión en la predicción de GEBV. Este estudio provee una ruta técnica validada para EGS que aborda el principal cuello de botella práctico en la mejora genética de ganado. Al asegurar una selección confiable sin comprometer el potencial de desarrollo, nuestro trabajo facilita la introgresión rápida de genética superior y representa un paso significativo hacia la escalabilidad de EGS, acelerando el progreso genético en ganado y otras especies.