QTL‐seq: mapeo rápido de loci de rasgos cuantitativos en arroz mediante resecuenciación del genoma completo de ADN de dos poblaciones agrupadas

La mayoría de los rasgos de cultivo agronómicamente importantes son cuantitativos, lo que significa que están controlados por múltiples genes, cada uno con un pequeño efecto (loci de rasgos cuantitativos, QTLs). El mapeo y la isolación de QTLs son importantes para la cría eficiente de cultivos mediante selección asistida por marcadores (MAS) y para una mejor comprensión de los mecanismos moleculares subyacentes a los rasgos. Sin embargo, dado que requiere el desarrollo y selección de marcadores de ADN para el análisis de ligamiento, el análisis de QTL ha sido lento y laborioso. Aquí informamos sobre la identificación rápida de QTLs vegetales mediante resecuenciación del genoma completo de ADN de dos poblaciones, cada una compuesta por 20-50 individuos que muestran valores de rasgos extremos opuestos para un fenotipo dado en una progenie segregante. Proponemos nombrar este enfoque QTL-seq aplicado a especies vegetales. Aplicamos QTL-seq a líneas endogamas recombinantes de arroz y poblaciones F2 y logramos identificar con éxito QTLs para rasgos agronómicos importantes, como la resistencia parcial a la enfermedad del tizón del arroz y el vigor de las plántulas. Un estudio de simulación mostró que QTL-seq puede detectar QTLs en amplios rangos de variables experimentales, y el método puede aplicarse generalmente en estudios de genómica poblacional para identificar rápidamente regiones genómicas que han sufrido barridos de selección artificial o natural.