Preferencia del sitio de inserción de los transposones Mu, Tn5 y Tn7

Resumen Antecedentes Los transposones, segmentos de ADN que pueden movilizarse a otras ubicaciones en un genoma, se utilizan a menudo para mutagénesis por inserción o para generar sitios de iniciación para la secuenciación de grandes moléculas de ADN. Para ambos usos, se desea un transposón con un sesgo de inserción mínimo para permitir una cobertura completa con un muestreo mínimo. Hallazgos Se utilizaron tres transposones, Mu, Tn5 y Tn7, para generar inserciones en el mismo conjunto de fosmidos que contiene ADN genómico de Candida glabrata. Tn7 demuestra un sesgo de inserción notablemente menor que Mu o Tn5, siendo ambos Mu y Tn5 sesgados hacia secuencias que contienen guanosina (G) y citidina (C). Esta preferencia de Mu y Tn5 produce un espaciado menos uniforme de las inserciones que para Tn7, en el genoma rico en adenosina (A) y timidina (T) de C. glabrata (39% GC). Conclusiones A la luz de su distribución más uniforme de inserciones, se debería considerar a Tn7 para aplicaciones en las que el sesgo de inserción sea perjudicial.