La Base Estructural del Reconocimiento Antígeno-Anticuerpo

La función de los anticuerpos (Abs) implica la unión específica a antígenos (Ags) y la activación de otros componentes del sistema inmunológico para combatir patógenos. Se asume ampliamente que los seis bucles hipervariables dentro de los dominios variables de los Abs, comúnmente denominados regiones determinantes de complementariedad (CDRs), son responsables del reconocimiento de Ags, mientras que se cree que los dominios constantes median la activación efectora. Estudios y análisis recientes del creciente número de estructuras de Ab disponibles indican que esta clara separación funcional entre las dos regiones puede ser una sobre-simplificación. Algunas posiciones dentro de los CDRs han demostrado no participar nunca en la unión a Ag y algunos residuos fuera de los CDRs a menudo contribuyen críticamente a la interacción con el Ag. Además, existe una creciente evidencia de efectos no locales e incluso alostéricos en la interacción Ab-Ag en la que la unión de Ag afecta la región constante y viceversa. Esta revisión resume y discute la base estructural del reconocimiento de Ag, elaborando sobre la contribución de diferentes determinantes estructurales del Ab a la unión y reconocimiento de Ag. Discutimos los CDRs, los diferentes enfoques para su identificación y su relación con la interfaz de Ag. También revisamos lo que se conoce actualmente sobre la contribución de las regiones no-CDRs al reconocimiento de Ag, a saber, las regiones de marco (FRs) y los dominios constantes. Se discuten los mecanismos sugeridos por los cuales estas regiones contribuyen a la unión de Ag. En el lado del Ag de la interacción, discutimos los intentos de predecir epítopos de células B y la idea sugerida de incorporar información de Ab en esquemas de predicción de epítopos de células B. Más allá de mejorar la comprensión de la inmunidad, la caracterización del papel funcional de diferentes partes de la molécula de Ab puede ayudar en la ingeniería de Ab, el diseño de péptidos derivados de CDR y la predicción de epítopos.