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La metilación de la quinta posición de la citosina (5mC) es una modificación epigenética importante del ADN. Se ha demostrado que los derivados oxidados de 5mC, a saber, 5-hidroximetilcitosina (5hmC), 5-formilcitosina (5fC) y 5-carboxilcitosina (5caC), existen de manera dinámica y tienen funciones regulatorias distintas. En el estudio actual, investigamos si hay cambios en los contenidos de los tres derivados oxidados de 5mC en el genoma del carcinoma hepatocelular (HCC) y exploramos más a fondo los mecanismos subyacentes. Mostramos que tanto los contenidos globales de 5hmC como de 5fC se redujeron significativamente en la etapa muy temprana (etapa 0, clasificación del cáncer de hígado de Barcelona BCLC) de HCC en comparación con los tejidos paratumorales. Notablemente, el contenido de 5fC continuó disminuyendo en la etapa avanzada (clasificación BCLC de 0 a A) de HCC. El contenido de 5caC en los tejidos de HCC estaba por debajo del umbral de detección. La infección por el virus de la hepatitis B (VHB) se asoció con la disminución de 5mC, 5hmC o 5fC en HCC; y las mediciones en líneas celulares integradas con o sin ADN de VHB mostraron resultados consistentes. Por otro lado, tanto el nivel de expresión de la enzima de translocación diez-once 2 (TET2) como el contenido de α-cetoglutarato se redujeron significativamente en HCC. Las correlaciones positivas significativas entre los niveles de expresión de enzimas relacionadas con la metilación del ADN en los tejidos paratumorales se atenuaron generalmente o incluso desaparecieron en los tejidos tumorales de HCC. Las disminuciones de los contenidos de 5hmC y 5fC en el ADN genómico se asociaron con un pronóstico pobre en pacientes con HCC. Conclusión: Los contenidos globales de 5hmC y 5fC se redujeron significativamente en la etapa muy temprana de HCC; la disminución de 5hmC y 5fC se debió principalmente a la disminución de 5mC y se asoció con la infección por VHB, la disminución de la actividad de la enzima TET y la expresión descoordinada de las enzimas relacionadas con la metilación del ADN.
Liu et al. (Mon,) estudiaron esta cuestión.