Recursos y estrategias comunitarias para el mapeo por asociación en sorgo

El mapeo por asociación es una estrategia poderosa para identificar genes subyacentes a rasgos cuantitativos en plantas. Hemos reunido y caracterizado la diversidad genética y fenotípica de un panel de sorgo Sorghum bicolor (L.) Moench apto para el mapeo por asociación, compuesto por 377 accesiones que representan todas las principales razas cultivadas (líneas tropicales de diversas regiones geográficas y climáticas), y líneas de cría importantes de EE. UU. y sus progenitores. Las accesiones fueron fenotipadas para ocho rasgos, y se evaluaron los niveles de estructura poblacional y parentesco familiar con 47 loci de repeticiones de secuencias simples (SSR). El panel mostró una variación morfológica sustancial y se observó poca diferenciación genotípica entre las líneas tropicales convertidas y las líneas de cría. Los datos fenotípicos y genotípicos se utilizaron para evaluar el rendimiento de varios modelos de asociación en el control de asociaciones espurias. Nuestro análisis indicó que los modelos de asociación que tomaron en cuenta tanto la estructura poblacional como el parentesco funcionaron mejor que aquellos que no lo hicieron. Además, encontramos que el número óptimo de subpoblaciones utilizado para corregir la estructura poblacional era dependiente del rasgo. Aunque la adición de datos genotípicos con loci SSR adicionales puede ser necesaria, los modelos de asociación, los datos genotípicos y el panel de germoplasma aquí descritos proporcionan un punto de partida para que los investigadores de sorgo comiencen estudios de asociación de rasgos y marcadores o genes candidatos de interés.