Nuevas perspectivas sobre la patogénesis de Acinetobacter baumannii reveladas por pirosecuenciación de alta densidad y mutagénesis por transposón

Acinetobacter baumannii ha emergido como un patógeno humano importante y problemático ya que es el agente causante de varios tipos de infecciones, incluyendo neumonía, meningitis, septicemia e infecciones del tracto urinario. Exploramos el contenido patogénico de este patógeno dañino utilizando una combinación de secuenciación de ADN y mutagénesis por inserción. El genoma de este organismo fue secuenciado utilizando una estrategia que involucra pirosecuenciación de alta densidad, un método novedoso y rápido de secuenciación de alto rendimiento. Excluyendo los repeticiones de rDNA, el genoma ensamblado tiene 3,976,746 pares de bases (pb) y tiene 3830 ORFs. Una fracción significativa de los ORFs (17.2%) se encuentra en 28 islas extranjeras putativas, lo que indica que el genoma ha adquirido una gran cantidad de ADN extranjero. Consistente con su papel en la patogénesis, un número notable de islas (16) contienen genes implicados en la virulencia, indicando que el organismo dedica una porción considerable de sus genes a la patogénesis. La isla más grande contiene elementos homólogos al aparato de secreción tipo IV de Legionella/Coxiella. Se ha demostrado que los sistemas de secreción tipo IV son importantes para la virulencia en otros organismos y, por lo tanto, es probable que ayuden a mediar la patogénesis de A. baumannii. La mutagénesis por inserción generó aislamientos avirulentos de A. baumannii y verificó que seis de las islas contienen genes de virulencia, incluyendo dos islas novedosas que contienen genes que carecían de homología con otros en las bases de datos. El enfoque de secuenciación de ADN descrito en este estudio permite la elucidación rápida de la secuencia de ADN de cualquier microbio y, cuando se combina con pruebas genéticas, puede identificar muchos genes novedosos importantes para la patogénesis microbiana.