UPFront y al centro en la degradación de ARN: UPF1 en la degradación mediada por nonsense del ARNm y más allá

La degradación mediada por nonsense del ARNm (NMD), que es, sin duda, la vía reguladora dependiente de traducción mejor caracterizada en mamíferos, degrada selectivamente los ARNm como un medio de control post-transcripcional de la expresión génica. El control puede tener como finalidad asegurar la calidad de la expresión génica. Alternativamente, el control puede facilitar la adaptación de las células a los cambios en su entorno. La clave para la NMD, sin importar su propósito, es la helicasa de ARN dependiente de ATP upstream frameshift 1 (UPF1), sin la cual la NMD no puede ocurrir. Sin embargo, UPF1 hace mucho más que regular la NMD. Como ejemplos, UPF1 está implicada en vías de degradación de ARNm funcionalmente diversas mediadas por una variedad de proteínas unidas al ARN que incluyen staufen, la proteína de unión a bucle de tallo, el receptor de glucocorticoides y regnase 1. Además, UPF1 promueve la degradación de microARN mediada por nucleasa similar a tudor-estafilocócica/micrococálica. En esta revisión, primero nos enfocamos en cómo la maquinaria de NMD reconoce un objetivo de NMD y desencadena la degradación del ARNm. A continuación, comparamos y contrastamos los mecanismos por los cuales UPF1 funciona en la degradación de otros ARNm y también en la degradación de microARN. UPF1, como un polimato, otorga a las células la capacidad de moldear su transcriptoma en respuesta a diversas necesidades biológicas y fisiológicas.