Comparación de los Niveles de Diversidad Bacteriana en Sedimentos de Agua Dulce, Humedales Intermareales y Marinos Utilizando Millones de Etiquetas de Illumina

El sedimento, un ámbito especial en los entornos acuáticos, tiene una alta diversidad microbiana. Si bien hay numerosos informes sobre la comunidad microbiana en sedimentos marinos, las comunidades de sedimentos de agua dulce e intermareales han sido pasadas por alto. El presente estudio determinó millones de lecturas de Illumina para una comparación de comunidades bacterianas en sedimentos de agua dulce, humedales intermareales y sedimentos marinos a lo largo del río Perla, China, utilizando un enfoque técnicamente consistente. Nuestros resultados muestran que tanto la riqueza como la equidad de taxones fueron más altas en el sedimento de agua dulce, medianas en el sedimento intermareal y más bajas en el sedimento marino. El alto número de secuencias permitió la determinación de una amplia variedad de linajes bacterianos en todos los sedimentos para análisis estadísticos confiables. El análisis de componentes principales mostró que los tres tipos de comunidades pudieron ser bien separados desde los niveles de filo hasta la unidad de taxonomía operacional (OTU), y las OTUs de abundantes a raros mostraron resoluciones satisfactorias. El análisis estadístico (LEfSe) demostró que el sedimento de agua dulce estaba enriquecido con Acidobacteria, Nitrospira, Verrucomicrobia, Alphaproteobacteria y Betaproteobacteria. El sedimento intermareal tenía una comunidad única con diversos productores primarios (como Chloroflexi, Bacillariophyta, Gammaproteobacteria y Epsilonproteobacteria), así como microbios saprófitos (como Actinomycetales, Bacteroidetes y Firmicutes). El sedimento marino tenía una mayor abundancia de Gammaproteobacteria y Deltaproteobacteria, que estaban principalmente involucrados en la reducción de sulfatos en condiciones anaerobias. Estos resultados son útiles para una comprensión sistemática de las comunidades bacterianas en entornos sedimentarios naturales.