La sintaxina 6 funciona en el tráfico de vesículas de la red de trans-Golgi.

La transferencia específica de vesículas entre orgánulos es crítica para generar y mantener la organización de los compartimentos membranosos dentro de las células. La sintaxina 6 es un miembro recientemente descubierto de la familia de sintaxinas, cuyos constituyentes son componentes necesarios de varias vías de tráfico de vesículas. Para comprender mejor la función de la sintaxina 6, generamos un panel de anticuerpos monoclonales que reconocen específicamente diferentes epítopos de la proteína. La microscopia electrónica de inmunoelectrones muestra que la sintaxina 6 se encuentra principalmente en la red de trans-Golgi (TGN), donde colocaliza parcialmente con la proteína adaptadora del TGN AP-1 en membranas recubiertas de clatrina. Un etiquetado adicional está presente en pequeñas vesículas en la vecindad de estructuras similares a endosomas. La inmunoprecipitación de la sintaxina 6 reveló que está presente en un complejo o complejos con la proteína de unión al NSF soluble alfa, la proteína de membrana asociada a vesículas 2, o cellubrevin y un homólogo mamífero de VPS45, que es un miembro de la familia sec1 implicada en el tráfico de Golgi a compartimentos prevacuolares en levaduras. Mostramos que el VPS45 mamífero se encuentra en múltiples tejidos, está parcialmente asociado a membranas y se enriquece en la región de Golgi. Líneas convergentes de evidencia sugieren que la sintaxina 6 media un evento de tráfico TGN, quizás dirigido a endosomas en células mamíferas.