Casos en los que los Métodos de Parsimonia o Compatibilidad serán Positivamente Engañosos

Para algunos casos simples de tres y cuatro especies que involucran un carácter con dos estados, se determina bajo qué condiciones varios métodos de inferencia filogenética fallarán en converger hacia la verdadera filogenia a medida que se acumulan más datos. Los métodos son el método de parsimonia de Camin-Sokal, el método de compatibilidad, y el método de parsimonia del árbol de Wagner no enraizado de Farris. En todos los casos, las condiciones para este fallo (que es el fallo en ser estadísticamente consistente) son esencialmente que los cambios paralelos superen los cambios informativos y no paralelos. Es posible que estos métodos sean inconsistentes incluso cuando el cambio es improbable a priori, siempre que las tasas evolutivas en diferentes linajes sean suficientemente desiguales. Es mediante la extensión de este enfoque que podemos proporcionar una metodología sólida para evaluar métodos de inferencia filogenética.