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El cáncer colorrectal (CCR) es una enfermedad heterogénea con cambios en los niveles genéticos y epigenéticos de varios genes. La evaluación molecular del CCR está ganando cada vez más atención, y además, hay un aumento en el uso de biomarcadores para la prognosticación de la enfermedad. Por lo tanto, la identificación de diferentes biomarcadores genéticos a través de los niveles de abundancia de ARN mensajero (ARNm) puede ser útil para capturar los efectos complejos del CCR. En este estudio, demostramos que los altos niveles de ARNm de 10 genes sobreexpresados (DPEP1, KRT80, FABP6, NKD2, FOXQ1, CEMIP, ETV4, TESC, FUT1 y GAS2) se observan en líneas celulares de CCR y conjuntos de datos públicos de CCR. Además, encontramos que una alta expresión de ARNm de DPEP1, NKD2, CEMIP, ETV4, TESC o FUT1 está significativamente correlacionada con un peor pronóstico en pacientes con CCR. Una investigación adicional revela que CTNNB1 es el factor clave en la interacción de la vía de señalización Wnt canónica con 10 genes asociados al CCR sobreexpresados. En particular, identificamos a NKD2, FOXQ1 y CEMIP como tres genes regulados por CTNNB1. Además, la inhibición individual de la expresión de estos tres genes regulados por CTNNB1 puede causar la inhibición del crecimiento de las células de CCR. Este estudio revela biomarcadores eficaces para el pronóstico del CCR y proporciona una nueva red de interacción molecular para el CCR.
Wu et al. (Mon,) estudiaron esta cuestión.
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