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Las ventajas de este programa sobre otro software son que es software libre de código abierto, puede analizar un gran número de secuencias simultáneamente, puede visualizar tanto la alineación de secuencias como los valores de similitud/identidad de manera concurrente, emplea alineación global en los cálculos, y ha sido formateado para funcionar tanto en los sistemas operativos Unix como en Microsoft Windows. Actualmente estamos completando la versión basada en Macintosh del programa.
Campanella et al. (Thu,) estudiaron esta cuestión.