El tracoma es la principal causa infecciosa de ceguera en el mundo y clásicamente se atribuye a Chlamydia trachomatis (Ct). Sin embargo, otros miembros del filo Chlamydiae, particularmente los organismos ambientales similares a clamidia (CLOs), pueden modificar la ecología ocular e influir en los resultados de la enfermedad. Aquí, investigamos la distribución, filogenia y asociaciones del microbioma de CLOs entre 1,059 individuos de comunidades endémicas de tracoma en Etiopía utilizando secuenciación dirigida del ARNr 16S y secuenciación metagenómica shotgun. Se detectaron CLOs en 249 (23.3%) participantes de todas las edades y sexos, y fueron significativamente menos asociados con Ct o cicatrización tracomatosa (TS) y triquiasis (TT). Los análisis filogenéticos revelaron una amplia diversidad de CLO con seis filotipos nuevos, siendo el más abundante ancestral a Sorochlamydiaceae—una familia que enlaza a Chlamydiaceae patógenos, que incluye el género Chlamydia, y simbiontes de protistas. Los microbiomas positivos para CLO mostraron una riqueza y equidad de especies significativamente mayores con diferencias claras en la composición comunitaria en comparación con los microbiomas negativos para CLO. Estos efectos fueron más pronunciados en varones y adultos mayores. El perfil funcional reveló un agotamiento generalizado de las vías biosintéticas y metabólicas en los microbiomas positivos para CLO, particularmente en participantes con TS/TT, lo que sugiere una capacidad biosintética comunitaria reducida y modificación del nicho. Los análisis de redes de interacción entre especies demostraron una reorganización sustancial de las asociaciones microbianas en presencia de CLOs, con mayor conectividad y centralidad comparado con redes negativas para CLO. Estos hallazgos identifican a los CLO como miembros prevalentes, filogenéticamente diversos y ecológicamente influyentes del microbioma. Su asociación inversa con Ct y TS/TT subraya la importancia de considerar simbiontes intracelulares más allá de Ct para entender la ecología microbiana conjuntival, su resiliencia, la patogénesis del tracoma y para diseñar nuevas estrategias de control.IMPORTANCIAEl tracoma causado por Chlamydia trachomatis (Ct) sigue siendo la principal causa infecciosa de ceguera a nivel mundial. Mientras que los esfuerzos de control se enfocan exclusivamente en Ct, otros miembros del filo Chlamydiae, como los organismos similares a clamidia (CLOs), habitan superficies mucosas pero están poco estudiados en el ojo. Mediante secuenciación dirigida del ARNr 16S y secuenciación metagenómica shotgun de muestras conjuntivales de habitantes rurales en Etiopía endémica de tracoma, se encontró que los CLOs eran prevalentes (23.3%; 249/1,059), filogenéticamente diversos, incluyendo filotipos nuevos de Chlamydiae, y estaban inversamente asociados tanto con la infección por Ct como con enfermedad cicatricial severa. Los microbiomas con CLO mostraron mayor diversidad microbiana, composición comunitaria alterada, disminución en la abundancia de vías metabólicas y reorganización de redes de interacción entre especies comparados con microbiomas sin CLO. Estos hallazgos cuestionan el enfoque exclusivo en Ct para el control e investigación del tracoma y sugieren que los CLO representan miembros ecológicamente significativos del microbioma conjuntival. Investigaciones adicionales sobre sus interacciones con las comunidades microbianas oculares podrían revelar nuevas perspectivas en la patogénesis del tracoma e informar enfoques más integrales para el control de esta enfermedad.
Olagoke et al. (jue,) estudiaron esta cuestión.