Identificación micro-Raman de células bacterianas del género Staphylococcus y dependencia de sus condiciones de cultivo

La contaminación microbiana no solo es un problema médico, sino que también desempeña un papel importante en la producción en salas limpias farmacéuticas y en la tecnología de procesamiento de alimentos. Por lo tanto, se han desarrollado muchas técnicas para lograr la diferenciación e identificación de microorganismos. Entre estos métodos, las técnicas espectroscópicas vibracionales (IR, Raman y SERS) son herramientas útiles debido a su rapidez y sensibilidad. Recientemente hemos demostrado que la espectroscopia micro-Raman en combinación con un máquina de soporte vectorial es un enfoque extremadamente capaz para una identificación rápida y fiable, no destructiva, en línea de bacterias individuales pertenecientes a diferentes géneros. Para simular diferentes condiciones ambientales, analizamos en esta contribución diferentes cepas de Staphylococcus con diversas condiciones de cultivo para evaluar nuestro método con un conjunto de datos fiable. Primero, se registraron espectros micro-Raman del material a granel y de células bacterianas individuales que se cultivaron bajo las mismas condiciones, y se utilizaron por separado para una clasificación quimotaxonómica distinta de las cepas. Además, se registraron espectros Raman de células bacterianas individuales que se cultivaron bajo varias condiciones para estudiar la influencia del cultivo en la capacidad de discriminación. Este conjunto de datos se analizó tanto con un análisis jerárquico de clúster (HCA) como con un máquina de soporte vectorial (SVM).