Caracterización fenotípica y genotípica de aislamientos de Escherichia coli enteroagregativa de la población pediátrica en Pakistán

Escherichia coli enteroagregativa (EAEC) son una de las principales causas de diarrea entre los niños. El objetivo de este estudio fue definir la frecuencia de EAEC entre niños con diarrea de áreas afectadas por inundaciones así como en casos esporádicos, determinar la resistencia a múltiples fármacos y evaluar la virulencia utilizando un modelo in vivo de patogénesis. Se recolectaron muestras de heces de 225 niños con diarrea desde 2010 hasta 2011 de áreas afectadas por inundaciones, así como de casos esporádicos en Pakistán. Los aislamientos de EAEC identificados fueron caracterizados por grupamiento filogenético, patrones de resistencia a antibióticos que incluyen el espectro de beta-lactamasa de espectro extendido, detección de polimorfismos de nucleótido simple en gyrA y parC, y potencial de virulencia utilizando la larva de cera, G. mellonella. Se identificaron un total de 35 (12.5%) aislamientos de EAEC confirmados entre los 225 aislamientos de E. coli. Los aislamientos de EAEC mostraron alta resistencia a tetraciclina, ampicilina y cefaclor. Un total de 34.28% fueron positivos para ESBL. La detección de polimorfismos de nucleótido simple reveló que 37.14% y 68.57% de los aislamientos fueron positivos para SNPs en gyrA (A660 -T660) y parC (C330 -T330), respectivamente. El grupamiento filogenético reveló que el grupo filogenético B2 fue más prevalente entre todos los aislamientos de EAEC analizados, seguido por D, A, B1 y no tipificables (NT). La infección de G. mellonella con EAEC mostró que la dosis infecciosa letal fue 100% mayor que el control de E. coli DH5 alfa. EAEC son prevalentes entre niños paquistaníes con diarrea, son altamente resistentes a los antibióticos y predominantemente pertenecen al grupo filogenético B2. La vigilancia epidemiológica de EAEC y otros patotipos de E. coli es fundamental para evaluar no solo el papel de estos patógenos en la enfermedad diarreica, sino también para determinar la extensión de la resistencia a múltiples fármacos en la población.