PAINS en el Ensayo: Mecanismos Químicos de Interferencia en el Ensayo e Inhibición Enzimática Promiscua Observada durante un HTS de Captura de Sulfhidrilos

Se gastan recursos significativos en la fase temprana del descubrimiento de fármacos persiguiendo inconscientemente artefactos y compuestos bioactivos promiscua, mientras que entender la base química de estos comportamientos adversos a menudo queda inexplorado en la búsqueda de compuestos líderes. Casi todos los resultados de nuestro reciente tamizaje de alta capacidad (HTS) para capturar sulfhidrilos dirigido a la acetiltransferasa de histonas Rtt109 eran tales compuestos. En este documento, caracterizamos la base química para la interferencia en el ensayo y la inhibición enzimática promiscua de varios quimio-tipos prominentes identificados por este HTS, incluidos algunos compuestos de interferencia pan-ensayo (PAINS). La espectrometría de masas de proteínas y ALARM NMR confirmaron que estos compuestos reaccionan de manera covalente con cisteínas en múltiples proteínas. Desafortunadamente, los compuestos que contienen estos quimio-tipos han sido publicados como activos de tamizaje en revistas de renombre e incluso se han promocionado como sondas químicas o candidatos preclínicos. Nuestra caracterización y identificación detalladas de tales quimio-tipos reactivos a tioles deberían acelerar la clasificación de compuestos molestos, guiar el diseño de bibliotecas de tamizaje y prevenir el seguimiento de materia química indeseable.