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ANTECEDENTES: Las enfermedades del tronco de la vid (ETVs) son un complejo de enfermedades causado por hongos patógenos de la madera pertenecientes a géneros como Phaeomoniella, Phaeoacremonium, Fomitiporia, Eutypa y miembros de la familia Botryosphaeriaceae. Sin embargo, la co-ocurrencia de estos hongos en vides sintomáticas y asintomáticas en abundancias equivalentes ha cuestionado su papel en las ETVs. Por lo tanto, aún carecemos de una buena comprensión de los hongos involucrados en las ETVs, sus interacciones y los factores que controlan su agrupamiento en las vides. Determinamos el microbioma fúngico y bacteriano en tejidos de madera de vides asintomáticas y sintomáticas de tres principales variedades griegas (Agiorgitiko, Xinomavro, Vidiano), cultivadas en zonas vitícolas geográficamente distintas, utilizando secuenciación de amplicón. RESULTADOS: Observamos que la variedad/biogeografía (factor agrupado) fue el determinante más fuerte del microbioma fúngico de la madera (p < 0.001, 22.7%), mientras que la condición de síntomas de ETV tuvo un efecto más débil pero aún significativo (p < 0.001, 3.5%), siendo prominente solo en la variedad Xinomavro. Variantes de Secuencia de Amplicón (ASVs) de varios hongos, reportadas como patógenos asociados a ETV, como Kalmusia variispora, Fomitiporia spp. y Phaemoniella chlamydosporα (el más dominante en nuestro estudio), se correlacionaron positivamente con las vides sintomáticas de manera dependiente de la variedad/zona vitícola. El análisis de Random Forest indicó a P. chlamydosporα, K. variispora, A. alternata y Cladosporium sp., como predictores altamente precisos de vides sintomáticas (0% de tasa de error). El microbioma bacteriano de la madera mostró patrones similares, siendo la biogeografía/variedad el principal determinante (p < 0.001, 25.5%) de su composición, seguido por el estado de ETV de las vides (p < 0.001, 5.2%). El análisis de abundancia diferencial reveló una correlación positiva universal (p < 0.001) de ASVs de Bacillus y Streptomyces con vides asintomáticas. El análisis de red identificó una red de co-ocurrencia negativa significativa entre estos géneros bacterianos y Phaemoniella, Phaeoacrominum y Seimatosporium. Estos resultados apuntan a una interacción beneficiosa para la planta entre Bacillus/Streptomyces y los patógenos de ETV. CONCLUSIONES: Nuestro estudio (a) proporciona evidencia de que las plantas sintomáticas de ETV soportan un microbioma fúngico de madera, mostrando patrones dependientes de variedad y biogeografía, que podrían utilizarse como un proxy para distinguir entre vides sanas y enfermas, (b) señala fuertes interacciones entre el microbioma bacteriano y fúngico de la madera en vides asintomáticas que deberían ser exploradas más a fondo en la búsqueda de la descubrimiento de nuevos agentes de biocontrol.
Bekris et al. (Wed,) estudiaron esta cuestión.