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La composición de la microbiota cecal humana es poco conocida debido a las dificultades de muestreo. Se recolectaron muestras de fluido cecal de ocho sujetos a través de un tubo intestinal. También se recolectaron heces. Se enumeraron anaerobios totales, anaerobios facultativos, bifidobacterias y Bacteroides mediante métodos de cultivo, y se cuantificaron los grupos filogenéticos predominantes mediante hibridación molecular utilizando un conjunto de seis sondas dirigidas a rRNA. Los números de anaerobios estrictos, bifidobacterias, Bacteroides y miembros del grupo Clostridium coccoides y subgrupo Clostridium leptum eran más bajos en el ciego. Los anaerobios facultativos representaron el 25% de las bacterias totales en el ciego frente al 1% en las heces.
Marteau et al. (Mon,) estudiaron esta cuestión.