Diversidad Genética y Estudio de Asociación a Escala Genómica de Rasgos Morfológicos y de Calidad en Durazno Utilizando Dos Colecciones de Germoplasma de Durazno Españolas

(L.) Batsch] es una de las especies de frutas de hueso más importantes en la producción mundial. La producción de durazno en España es actualmente la segunda más grande del mundo y las variedades disponibles en España incluyen una gran fuente de diversidad genética con variabilidad en rasgos de calidad de fruta y tolerancia a trastornos postcosecha. Para explorar la diversidad genética y las asociaciones entre polimorfismos de nucleótido único (SNP) y rasgos en el germoplasma español, se utilizó el nuevo array de SNP de 18K v2 para genotipar 287 accesiones pertenecientes a las dos Colecciones Nacionales de Germoplasma de Durazno ubicadas en el Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón (CITA) y en la Estación Experimental de Aula Dei (EEAD)-CSIC. La alta densidad del nuevo array de SNP permitió la identificación de 30 grupos de sinonimias, que no se habían identificado antes utilizando marcadores de baja densidad. Además, se detectó un posible evento molecular a gran escala en 'Starcrest', un deporte de 'Springcrest', mostrando un posible reemplazo de un cromosoma en una región de 13.5 Mb. Sugerencias anteriores sobre las regiones de diversificación española coincidieron con nuestros resultados de diversidad genética y decaimiento del desequilibrio de ligamiento (LD) utilizando marcadores de alta densidad. Un estudio de asociación a escala genómica (GWAS) detectó 34 asociaciones significativas de SNP-rasgo con el tipo de glándulas foliares (TLG), la pubescencia del fruto (FH) y la textura de la pulpa (FT). El impacto de los SNP significativos fue estudiado con SnpEff. Los genes candidatos codifican varias proteínas familiares importantes involucradas en la formación de tricomas y resistencia al oídio (vinculado a TLG en durazno). La distancia genética entre las variedades obtenidas, junto con las asociaciones de SNP-rasgo encontradas, proporcionan nuevos conocimientos para selección asistida por marcadores y enfoques de cruzamiento en programas de mejora del durazno.