Redes regulatorias ceRNA asociadas a circRNA en las respuestas cardíacas a la hipoxia de gran altitud en cerdos tibetanos (Sus scrofa)

La adaptación hipóxica a gran altitud en mamíferos implica mecanismos moleculares complejos, con ARN no codificantes (ncARN) que se reportan cada vez más como participantes en la regulación relacionada con la hipoxia. Sin embargo, la contribución de los circARN en la adaptación cardíaca a la hipoxia crónica sigue siendo en gran medida inexplorada. Este estudio realizó un análisis integrador de ARN endógeno competitivo (ceRNA) para investigar redes regulatorias mediadas por circARN en los corazones de cerdos tibetanos y cerdos Yorkshire mantenidos en condiciones de gran y baja altitud, utilizando cuatro grupos de comparación (TH, TL, YH y YL). Usando secuenciación de ARN Ribo-Zero, identificamos 961 circARN en tejidos cardíacos, con 358 circARN diferencialmente expresados (DE-circARN) detectados en los cuatro grupos. El análisis de enriquecimiento funcional reveló que sus genes anfitriones estaban asociados con vías relacionadas con la hipoxia, incluyendo HIF-1, VEGF, AMPK y autofagia, críticas para el metabolismo energético y la función mitocondrial. Se construyó una red ceRNA específica de HIF-1, identificando ejes clave que incluyen circDUSP16–ssc-miR-671-5p–CAMK2A, circTLK1–ssc-miR-331-3p–SERPINE1 y circTLK1–novel-miR-624–ENO1. El análisis de JASPAR predijo posibles sitios de unión de HIF-1α en los promotores de ENO1, SERPINE1 y CAMK2A, apoyando sus roles regulatorios. Estos hallazgos brindan una visión transcriptómica de los patrones de expresión de circARN en tejidos cardíacos de cerdos bajo diferentes condiciones de altitud y priorizan relaciones ceRNA candidatas para una investigación funcional adicional.