Tasas de sustitución de nucleótidos sinónimos en genes de mamíferos: implicaciones para el reloj molecular y la relación de los órdenes de mamíferos.

Las tasas de sustitución sinónimas se han estimado para 58 genes comparados entre primates, artiodáctilos y roedores. Aunque se podría esperar que los sitios silenciosos sean neutros, existe una variación sustancial en la tasa entre genes dentro de cada linaje. Parte de la variación de la tasa está asociada con el contenido de G + C: los genes con valores intermedios de G + C tienen las tasas más altas. Sin embargo, permanece una heterogeneidad considerable después de corregir por el contenido de G + C. Las tasas de sustitución sinónimas también varían entre linajes, pero las tasas relativas de los genes están bien conservadas en diferentes linajes. Ciertos genes también han sido secuenciados en un cuarto orden (lagomorfo o carnívoro), y estos datos se han utilizado para investigar la filogenia de los mamíferos. Los datos sobre lagomorfos son consistentes con una filogenia estelar, pero hay evidencia de que los carnívoros y los artiodáctilos son grupos hermanos. Los genes secuenciados en ratas y ratones sugieren que la tasa de sustitución aumentada en roedores ha ocurrido desde la divergencia entre rata y ratón.