Las redes transcripcionales integradas y de ARN endógeno competitivo se regulan mutuamente en entornos moleculares permisivos

Los ARN endógenos competitivos (ce) se regulan mutuamente a través de la secuestración de microARN compartidos y forman redes regulatorias complejas basadas en su firma de microARN. Sin embargo, los requisitos moleculares para la regulacion cruzada de ceARN y la extensión de las redes de ceARN siguen siendo desconocidos. Aquí, presentamos un modelo matemático de acción de masa para determinar las condiciones óptimas para la actividad de ceARN in silico. Este modelo se validó utilizando la fosfatasa y homólogo de tensina (PTEN) y su proteína asociada de ceARN asociada a la proteína de membrana de vesícula (VAPA) como ejemplos paradigmáticos. Una evaluación computacional de la complejidad de las redes de ceARN reveló que las redes de factores de transcripción y de ceARN están íntimamente entrelazadas. Notablemente, encontramos que las redes de ceARN son sensibles a la regulación al alza de factores de transcripción o su expresión aberrante en el cáncer. Así, dadas las condiciones moleculares óptimas, las alteraciones de un ceARN pueden tener efectos sorprendentes en las redes integradas de ceARN y transcripcionales.