Variante en el sitio de empalme de OCA2 en perros Spitz alemanes con albinismo oculocutáneo

Investigamos una familia de perros Spitz alemanes donde el cruce de un macho negro con una hembra blanca produjo tres cachorros con un color de pelaje marrón claro inesperado, labios y narices ligeramente pigmentados y ojos azules. Un análisis combinado de ligadura y homocigosidad basado en un modo de herencia autosómica recesiva monogénica completamente penetrante identificó un intervalo crítico de 15 Mb en el cromosoma 3. Obtuvimos datos de secuenciación del genoma completo de un perro afectado, tres lobos y 188 perros de control. Filtrando variantes privadas, se reveló una única variante con impacto alto predicho en el intervalo crítico en LOC100855460 (XM₀05618224. 1: c. 377+2T>G LT844587. 1: c. -45+2T>G). La variante co-segregó perfectamente con el fenotipo en la familia. Genotipamos 181 perros de control con pigmentación normal de diversas razas, incluyendo 22 perros Spitz alemanes no relacionados, que eran todos homocigotos salvajes. Análisis de secuencia comparativa revelaron que LOC100855460 representa en realidad el extremo 5' del gen OCA2 canino. La ensambladura del genoma de referencia CanFam 3. 1 es incorrecta y separa los primeros dos exones de los exones restantes del gen OCA2. Amplificamos un fragmento de cDNA de OCA2 canino mediante RT-PCR y determinamos la secuencia correcta de mRNA de longitud completa (LT844587. 1). Las variantes en el gen OCA2 causan albinismo oculocutáneo tipo 2 (OCA2) en humanos, dilución de ojos rosas en ratones y fenotipos similares en serpientes de maíz, medaka y el pez tetra de cueva mexicano. Por lo tanto, concluimos que el albinismo oculocutáneo observado en los perros Spitz alemanes es probablemente causado por la variante identificada en el sitio de empalme 5' del primer intrón del gen OCA2 canino.