Sobre la importancia de ser co-transcripcional

La intensa investigación en los últimos años ha demostrado que muchos eventos de procesamiento de pre-mRNA son co-transcripcionales o al menos comienzan durante la síntesis de RNA por la RNA polimerasa II (Pol II). Pero, ¿es importante que el procesamiento de pre-mRNA ocurra de manera co-transcripcional? Mientras que la Pol II dirige el encapsulado 5' de mRNA al unirse y reclutar las tres actividades de encapsulado a las unidades de transcripción, el empalme co-transcripcional no es obligatorio. En algunos casos, como el empalme alternativo, el empalme puede ocurrir post-transcripcionalmente debido a la cinética más lenta de empalme de intrones desfavorables. A pesar de los modelos recientes en los que los factores de empalme están unidos directamente al dominio C-terminal (CTD) de la Pol II, hay poca evidencia que apoye esa visión. En su lugar, las interacciones entre snRNPs y factores de elongación de transcripción proporcionan la evidencia molecular más fuerte de un vínculo físico entre transcripción y empalme. La terminación de la transcripción depende de señales de poliadenilación, pero, al igual que el empalme, la poliadenilación por sí misma probablemente comienza de manera co-transcripcional y continúa post-transcripcionalmente. El RNA naciente juega un papel importante en la determinación de qué transcritos son poliadenilados y qué exón terminal alternativo se utiliza. Un añadido reciente al procesamiento de RNA co-transcripcional es un posible paso de vigilancia de RNA antes de la liberación del mRNP de la unidad de transcripción, que parece coordinar el transporte nuclear con el procesamiento de mRNA y puede estar mediado por componentes del exosoma nuclear.