Análisis de secuencia comparativa a gran escala de los loci de la tirosina quinasa de Bruton humana y murina revela dominios regulatorios conservados

La secuenciación de ADN genómico a gran escala de loci ortólogos y parálagos en diferentes especies debería contribuir a una comprensión básica de la evolución de las regiones codificadoras de proteínas y de los elementos reguladores no codificantes. Comparamos 93 kb de secuencia humana con 89 kb de secuencia de ratón en la región de la tirosina quinasa de Bruton (BTK). Además de mostrar la conservación de tanto la posición como la orientación de los cinco genes funcionalmente no relacionados en la región (BTK, alfa-D-galactosidasa A, L44L, FTP-3 y FCI-12), la comparación reveló la conservación de grupos de secuencias no codificantes que flanquean el primer exón de cada gen. Además, en la comparación de secuencias en el locus de BTK, la conservación de grupos de secuencias no codificantes se extiende a lo largo del locus; la secuencia no codificante está más altamente conservada en el locus de BTK en comparación con los loci flanqueantes. Esto sugiere una correlación con la compleja regulación del desarrollo de la expresión de btk. Para determinar si un segmento altamente conservado de 3.5 kb flanqueando el primer exón de BTK contiene señales regulatorias transcripcionales, probamos varias porciones del segmento para actividad de promotor y de expresión en varias líneas celulares apropiadas. Los resultados demuestran la contribución de la región conservada que flanquea el primer exón al patrón de expresión específico de la línea celular de btk. Estos datos muestran la utilidad de comparaciones de secuencias a gran escala para centrar la investigación en regiones de secuencias no codificantes que juegan roles esenciales en la regulación genética compleja.