Nuevas familias funcionales (FunFams) en CATH para mejorar la asignación de sitios funcionales conservados a estructuras en 3D

La versión 3.5 de CATH (Clase, Arquitectura, Topología, Homología, disponible en http://www.cathdb.info/) contiene 173 536 dominios, 2626 superfamílias homólogas y 1313 grupos de pliegues. Al centrarnos en estructuras de genómica estructural (SG), observamos que el número de nuevos pliegues para CATH v3.5 es ligeramente menor que en versiones anteriores, y esta observación sugiere que ahora podríamos conocer la mayoría de los pliegues que son fácilmente accesibles para la determinación de estructuras. Hemos mejorado la precisión de nuestro método de subclasificación de familias funcionales (FunFams) y la herramienta de búsqueda de dominios de secuencia de CATH se ha ampliado para proporcionar anotaciones de FunFam para cada dominio. El sitio web de CATH ha sido rediseñado. Hemos mejorado la visualización de datos funcionales y de características de secuencia conservadas asociadas con FunFams dentro de cada superfamilia de CATH.