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Aunque las proteínas celulares degradadas por proteasomas son la fuente de la mayoría de los péptidos antigénicos presentados en las moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad de clase I, se desconoce si los péptidos de ocho a nueve residuos que encajan en el surco de unión de las moléculas de clase I son producidos directamente solo por proteasomas in vivo. Si el péptido de ocho residuos SIINFEKL de la ovalbumina de pollo se extiende por uno o varios residuos en su extremo C y se microinyecta en células o se expresa a partir de un minígeno, es procesado y presentado en el complejo mayor de histocompatibilidad de clase I. Sin embargo, el procesamiento y la presentación son inhibidos por inhibidores de proteasomas, como la lactacistina. En contraste, cuando SIINFEKL se extiende por 2 a 25 residuos en su extremo N, su presentación no es bloqueada por inhibidores de proteasomas. El procesamiento en el extremo N también puede ocurrir cuando el péptido extendido se inserta cotranslacionalmente en el retículo endoplásmico. Así, se pueden distinguir dos pasos proteolíticos diferentes en la generación de un péptido presentado por la ovalbumina de pollo. La escisión por el proteasoma define el extremo C adecuado, mientras que enzimas peptidasa distintas en el citosol o retículo endoplásmico pueden generar el extremo N apropiado a partir de péptidos extendidos.
Craiu et al. (Tue,) estudiaron esta cuestión.