La Filogenia de los Procariotas

Por primera vez, se ha utilizado un único enfoque experimental, la caracterización de la secuencia del ARN ribosomal 16 S, para desarrollar una visión general de las relaciones filogenéticas en el mundo bacteriano. La técnica permite rastrear las relaciones hasta el ancestro común de toda la vida existente. Este primer vistazo a la filogenia bacteriana revela un mundo cuyas raíces parecen abarcar más de 3 mil millones de años. Existe una profunda división filogenética entre las bacterias, que requiere su división en dos líneas principales de descendencia, las arqueobacterias y las verdaderas bacterias (o eubacterias). Es un hallazgo general que los fenotipos bacterianos más antiguos son anaerobios, y que los fenotipos aeróbicos han surgido en varias ocasiones. Los fenotipos fotosintéticos también son extremadamente antiguos. Muchos grupos no fotosintéticos parecen haber surgido de un ancestro fotosintético, lo que lleva a cuestionar la creencia generalmente sostenida de que las primeras bacterias eran heterótrofas anaerobias. Las dos líneas últimas de descendencia bacteriana no están más estrechamente relacionadas entre sí que cualquiera de ellas con el aspecto citoplasmático de la célula eucariota. Sin embargo, dado que la célula eucariota es un quimera filogenética, no puede ser vista como una línea de descendencia comparable a las dos líneas bacterianas, aunque algunas de sus partes individuales pueden ser vistas así. De esta manera, el cloroplasto y quizás el mitocondrio son cada uno eubacterianos, y al menos una proteína ribosomal es arqueobacteriana. Una tercera línea de descendencia que no es ni eubacteriana ni arqueobacteriana está representada en el ARN ribosomal 18 S.