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Este artículo propone un 'modelo de estructura dual' para explicar la historia poblacional de los japoneses, incluyendo a los isleños de Okinawa (Ryukyu) y los ainu bajo una sola hipótesis. El modelo asume que los primeros ocupantes del archipiélago japonés provinieron de algún lugar del sureste asiático en la edad paleolítica superior y dieron origen a las personas de la edad jomon neolítica, o jomonenses; luego, la segunda ola de migración desde el noreste de Asia tuvo lugar en y después de la edad yayoi aeneolítica; y las poblaciones de ambas líneas gradualmente se mezclaron entre sí. El 'modelo de estructura dual' también asume que la mezcla poblacional sigue ocurriendo y que la estructura dual de la población japonesa se mantiene incluso hoy. Así, varias diferencias regionales, como las que existen entre el este y el oeste de Japón en características físicas y culturales, pueden ser explicadas por las tasas variables de mezcla de una región a otra. En general, este modelo concuerda bien no solo con la evidencia física y cultural, sino también con pruebas no humanas reveladas por perros japoneses, ratones, etc. Al mismo tiempo, el modelo proporciona una manera razonable de explicación respecto a las relaciones entre los isleños de las principales islas japonesas, Ryukyus y ainu.
Kazurō Hanihara (Martes) estudió esta cuestión.