Terminizer - Asistiendo la Marcación de Texto Usando Términos Ontológicos

Resumen Presentamos una herramienta que detecta automáticamente términos ontológicos en texto libre. Una vez que se han identificado los términos candidatos, los resultados se muestran superpuestos en el texto original o en una lista organizada por la ontología y frecuencia. El usuario puede aceptar o rechazar interactivamente cada coincidencia, o intentar encontrar una coincidencia más apropiada explorando la red de conceptos ontológicos por sí mismos. En los recursos ontológicos típicos, el padre o los padres de un término representan conceptos más amplios, mientras que los hijos de un término representan conceptos más específicos. De esta manera, la coincidencia sugerida puede usarse como un punto de partida para que el usuario encuentre un término más adecuado. La interfaz del navegador de ontología incorpora una visualización gráfica que utiliza Flash para presentar una vista interactiva de la ontología. Los "servicios Terminizer":http://terminizer.org/ ofrecen el conjunto completo de ontologías obtenidas de OBO Foundry, una colección de más de 40 ontologías biológicas en un formato común. Cualquier ontología disponible en el formato OBO estándar puede añadirse fácilmente a la base de datos. Además del modo interactivo, el software también está disponible como un servicio web. Tanto el servicio de detección de términos como la capa de presentación interactiva pueden incorporarse dentro de otros sitios web o programas.