Corte endonucleolítico específico de estructura de ácidos nucleicos por ADN polimerasas eubacterianas

Las exonucleasas 5' previamente conocidas de varias ADN polimerasas eubacterianas han demostrado ser ahora endonucleasas específicas de estructura que cortan ADN o ARN de cadena sencilla en el extremo bifurcado de un dúplex pareado por bases. El corte no estaba acoplado a la síntesis, aunque los iniciadores aceleraban considerablemente la tasa de corte. La enzima parecía acceder al sitio de corte moviéndose desde el extremo libre de una extensión 5' hacia la bifurcación del dúplex, donde tuvo lugar el corte. Se cortaron brazos de ADN de cadena sencilla de 5' de hasta 200 nucleótidos de longitud de tal dúplex. Prácticamente cualquier ácido nucleico lineal de cadena sencilla puede ser objetivo de un corte específico por la nucleasa 5' de la ADN polimerasa a través de hibridación con un oligonucleótido que convierte el sitio de corte deseado en un sustrato.