Influencia de las variables de biospecímenes en los biomarcadores proteómicos en el cáncer de mama

ANTECEDENTES: La señalización PI3K/Akt/mTOR se está persiguiendo activamente como un objetivo terapéutico para el cáncer de mama. Buscamos determinar si la heterogeneidad tumoral y las variables de biospecímenes afectan la evaluación de los marcadores de la vía PI3K/Akt/mTOR. MÉTODOS: Se recolectaron prospectivamente biopsias por aguja en el tejido (CNB), y muestras tumorales quirúrgicas centrales y periféricas en 53 pacientes con cáncer de mama invasivo. Las muestras se evaluaron con arreglos de proteínas de fase inversa (RPPA) e inmunohistoquímica (IHC). RESULTADOS: Hubo una correlación moderada o fuerte entre la expresión de 149 (97%) de los 154 diferentes marcadores RPPA en el centro y la periferia. La correlación fue mayor para tumores más pequeños, en pacientes que no se sometieron a terapia neoadyuvante y con un tiempo de isquemia en frío más corto. De 154 marcadores, 132 (86%) no mostraron diferencias estadísticamente significativas entre el centro y la periferia, y 97 (63%) no fueron diferentes entre el CNB y la muestra quirúrgica (promedio de la muestra central y periférica). pAkt S473 y PTEN tuvieron una correlación significativa entre las muestras centrales y periféricas, y entre CNB y la muestra quirúrgica. Sin embargo, los niveles de pAkt S473, pS6 S235/236, y pS6 240/244 fueron significativamente más altos en CNB que en las muestras centrales tanto por RPPA como por IHC. CONCLUSIONES: La mayoría de los biomarcadores proteómicos individuales estudiados no tienen heterogeneidad intratumoral significativa. Sin embargo, los niveles de proteínas y fosfo-proteínas se ven afectados por el tipo de biospecímen y otras variables preanalíticas. La activación de la vía PI3K es mayor en CNB en comparación con las muestras quirúrgicas postexéresis, lo que sugiere una posible pérdida de fosforilación durante la manipulación quirúrgica o con la isquemia en frío de las muestras quirúrgicas.