Las expansiones clonales en la infección aguda por EBV son detectables en el subconjunto de CD8 y no en el de CD4, y persisten con un fenotipo CD45 variable

Hemos aplicado un análisis global sensible de la heterogeneidad del TCR para comparar la dinámica clonal de las células T CD4(+) y CD8(+) en la mononucleosis infecciosa aguda. Con este enfoque, somos capaces de identificar una amplia representación de la población total específica del virus sin el sesgo de los cultivos in vitro y luego rastrear su fenotipo y destino a través de su huella molecular única. Demostramos un gran número de clones impulsados por Ag utilizando diferentes TCR en la fase aguda, todos CD8(+). Los diversos grandes clones generados en el subconjunto de CD8 en respuesta a este virus contrastan con la falta completa de expansión clonal detectable en el compartimento de CD4. Muchos de los mismos clones permanecen detectables en células T CD8(+) ex vivo directamente durante al menos un año después de la resolución de la mononucleosis infecciosa, aunque el tamaño del clon se reduce. Así, las células de memoria CD8 después de la infección por EBV persisten en una frecuencia circulante relativamente alta y representan un subconjunto del amplio rango de clonotipos que comprenden los efectores agudos. La separación de muestras en fracciones CD45RA (naïve) y CD45RO (memoria) muestra la acumulación de clonotipos definidos por la región CDR3 idénticos en ambas fracciones CD45RO y CD45RA, y la secuenciación confirma que las expansiones monoclonales dominantes de larga duración pueden residir en el reservorio CD45RA.