Un análisis in silico integral de los SNPs no sinónimos perjudiciales de la proteína FOXP2 humana

FOXP2 codifica el factor de transcripción forkhead que juega un papel significativo en el desarrollo del lenguaje. Los polimorfismos de un solo nucleótido en FOXP2 se han relacionado con trastornos del habla y del lenguaje, autismo, cáncer y esquizofrenia. Por lo tanto, examinar los SNPs funcionales para comprender mejor su asociación en enfermedades es una tarea difícil. El objetivo del presente estudio fue identificar los SNPs de cambio de sentido que tienen efectos estructurales y funcionales perjudiciales en la proteína FOXP2. Se emplearon múltiples herramientas computacionales para investigar el papel perjudicial de los SNPs no sinónimos. Se encontraron cinco variantes como Y531H, L558P, R536G y R553C asociadas a enfermedades y ubicadas en el dominio forkhead de la proteína FOXP2. El análisis de acoplamiento molecular del dominio de unión a ADN de FOXP2 con su secuencia objetivo más común 5'-CAAATT-3' predijo que las variantes mutantes R553C y L558P desestabilizan la estructura de la proteína al cambiar las interacciones de la interfaz proteína-ADN y la interrupción de enlaces de hidrógeno que pueden reducir la especificidad y afinidad de la unión. Se necesitan más investigaciones experimentales para verificar si este tipo de variaciones estructurales y funcionales desregulan las actividades de la proteína e inducen la formación de enfermedades.