La Flexibilidad de los Ácidos Nucleicos: (II) El Cálculo de la Energía Interna y Aplicaciones al ADN de Repetición de Mononucleótidos

Se presentan resultados sobre la flexibilidad del ADN de repetición de mononucleótidos utilizando una metodología novedosa, denominada "SIR", para describir cambios continuos en la estructura del ácido nucleico. Esta metodología, combinada con cálculos de energía interna y gradientes de energía analíticos, nos permite determinar conformaciones óptimas de poly(dG).poly(dC) y poly(dA).poly(dT) tanto en las formas A como B, teniendo en cuenta la influencia del medio solvente y de los contraiones explícitos. Posteriormente, se investigan varios tipos diferentes de distorsión de estas estructuras óptimas. Se muestra que se obtiene una excelente correlación con resultados experimentales respecto a cambios acoplados en variables estructurales y también se detectan varias nuevas correlaciones.