Inferencia rápida de haplotipos para familias nucleares

Hapi es un nuevo algoritmo de programación dinámica que ignora estados y transiciones de estado no informativos para calcular de manera eficiente haplotipos de mínimo recombinante y de máxima verosimilitud. Al aplicarse a un conjunto de datos que contiene 103 familias, Hapi funciona 3.8 y 320 veces más rápido que los algoritmos más avanzados. Dado que Hapi inferencia tanto haplotipos de mínimo recombinante como de máxima verosimilitud y se aplica a individuos relacionados, los haplotipos que infiere son altamente precisos sobre distancias genómicas extensas.