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cgpPindel es una versión modificada de Pindel que está optimizada para detectar inserciones y eliminaciones somáticas (indels) en genomas de cáncer y otras muestras en comparación con un control de referencia. Los filtros post-hoc eliminan las llamadas de falsos positivos, lo que resulta en un conjunto de datos de alta calidad para análisis posteriores. Esta unidad proporciona instrucciones concisas tanto para una ejecución simple 'de un tiro' de cgpPindel como para un enfoque más detallado adecuado para granjas de computación a gran escala.
Raine et al. (Martes,) estudiaron esta cuestión.