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En este estudio, se mapeó el proteoma del líquido cefalorraquídeo (LCR) humano utilizando tres estrategias diferentes antes del análisis de LC-MS/MS con Orbitrap: SDS-PAGE y una mezcla de fase reversa-excambio aniónico para mapear el proteoma global del LCR, y captura de glicopéptidos basada en hidrazida para mapear glicopéptidos. Se identificó un conjunto máximo de 3081 proteínas (28,811 secuencias de péptidos), de las cuales 520 fueron identificadas como glicoproteínas de la estrategia de enriquecimiento de glicopéptidos, incluyendo 1121 glicopéptidos y sus sitios de glicosilación. Hasta donde sabemos, este es el mayor número de proteínas y glicopéptidos identificados reportados para el LCR, incluyendo 417 sitios de glicosilación no reportados previamente. A partir de muestras de plasma paralelas, identificamos 1050 proteínas (9739 secuencias de péptidos). Se encontró un solapamiento de 877 proteínas entre los dos fluidos corporales, mientras que 2204 proteínas fueron identificadas solo en LCR y 173 solo en plasma. Todos los resultados del mapeo están disponibles de forma gratuita a través del nuevo Recurso del Proteoma del LCR (http://probe.uib.no/csf-pr), que se puede utilizar para navegar por el proteoma del LCR y ayudar a guiar la selección de péptidos de firma en proteómica cuantitativa dirigida.
Guldbrandsen et al. (Sat,) estudiaron esta cuestión.