Una nueva medida de distancia de secuencia para la construcción de árboles filogenéticos

MOTIVACIÓN: La mayoría de los enfoques existentes para la inferencia filogenética utilizan alineación múltiple de secuencias y asumen algún tipo de modelo evolutivo. La estrategia de alineación múltiple no funciona para todos los tipos de datos, por ejemplo, filogenia de genoma completo, y los modelos evolutivos no siempre pueden ser correctos. Proponemos una nueva medida de distancia de secuencia basada en la información relativa entre las secuencias utilizando la complejidad de Lempel-Ziv. La matriz de distancia así obtenida puede ser utilizada para construir árboles filogenéticos. RESULTADOS: El enfoque propuesto no requiere alineación de secuencias y es totalmente automático. El algoritmo ha construido con éxito filogenias consistentes para conjuntos de datos reales y simulados. DISPONIBILIDAD: Disponible a solicitud de los autores.