MultiCoil: Un programa para predecir coiled coils de dos y tres hebras

Se implementa un nuevo enfoque de puntuación multidimensional para identificar y distinguir coiled coils triméricos y diméricos en el programa MultiCoil. El programa extiende el programa de predicción de coiled coils de dos hebras PairCoil a la identificación de coiled coils de tres hebras. Los cálculos se basan en datos recopilados de una base de datos de coiled coils de tres hebras que comprende 6,319 residuos de aminoácidos, así como de la base de datos de coiled coils de dos hebras previamente construida. Además de identificar coiled coils no predichos por los programas de la base de datos de dos hebras, MultiCoil clasifica con precisión los estados de oligomerización de los coiled coils diméricos y triméricos conocidos. El análisis de las puntuaciones de MultiCoil proporciona información sobre las características estructurales de los coiled coils y produce estimaciones que indican que el 0.9% de todos los residuos de proteínas forman coiled coils de tres hebras y que el 1.5% forma coiled coils de dos hebras. El programa MultiCoil está disponible en http:/(/)theory.lcs.mit.edu/multicoil.