El verificador de singularidad de péptidos de neXtProt: una herramienta para la comunidad de proteómica

RESUMEN: El verificador de singularidad de péptidos de neXtProt permite a los científicos definir qué péptidos se pueden usar para validar la existencia de proteínas humanas, es decir, mapear de manera única frente a múltiples secuencias de proteínas humanas teniendo en cuenta sustituciones isobáricas, empalmes alternativos y variantes de un solo aminoácido. DISPONIBILIDAD E IMPLEMENTACIÓN: El programa pepx está disponible en https://github.com/calipho-sib/pepx y se puede ejecutar desde la línea de comandos o a través de una interfaz web CGI. La indexación requiere un archivo de secuencia en formato FASTA. La herramienta de verificación de singularidad de péptidos está disponible gratuitamente en la web en https://www.nextprot.org/tools/peptide-uniqueness-checker y desde la API de neXtProt en https://api.nextprot.org/. CONTACTO: lydie.lane@sib.swiss.