El Navegador del Genoma 3D: un navegador basado en la web para visualizar la organización del genoma en 3D y las interacciones de cromatina a largo alcance

Aquí, presentamos el Navegador del Genoma 3D, http://3dgenome.org, que permite a los usuarios explorar cómodamente tanto sus propios datos de interacción de cromatina como más de 300 datos de interacción de cromatina disponibles públicamente de diferentes tipos. Diseñamos un nuevo formato de datos binarios para datos Hi-C que reduce el tamaño del archivo al menos en un orden de magnitud y permite a los usuarios visualizar interacciones de cromatina a través de millones de pares de bases en segundos. Nuestro navegador proporciona múltiples métodos para vincular elementos cis-regulatorios distales con sus genes objetivos potenciales. Los usuarios pueden integrar sin problemas miles de otros datos ómicos para obtener una vista completa tanto del paisaje regulador como de la estructura del genoma en 3D.