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En un esfuerzo por ampliar aún más el número de objetivos para el desarrollo de agentes antirretrovirales, hemos utilizado un ensayo de integrasa in vitro para investigar una variedad de compuestos, incluidos inhibidores de la topoisomerasa, agentes antipalúdicos, uniones a ADN, naftoquinonas, el flavonoide quercetina, y el éster fenetílico del ácido cafeico como posibles inhibidores de la integrasa del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1. Nuestros resultados muestran que, aunque varios inhibidores de la topoisomerasa --incluidos la doxorubicina, la mitoxantrona, las elipticinas y la quercetina-- son inhibidores potentes de la integrasa, otros inhibidores de la topoisomerasa --como la amsacrina, el etopósido, el tenipósido y la camptotecina-- son inactivos. Otros intercaladores, como la cloroquina y el intercalador bifuncional ditercalinio, también son activos. Sin embargo, la unión al ADN no se correlaciona estrechamente con la inhibición de la integrasa. El intercalador 9-aminoacridina y los formadores de ADN de la hendidura menor espermina, espermidina y distamicina no tienen efecto, mientras que los no formadores de ADN primaquina, 5,8-dihidroxi-1,4-naftoquinona y el éster fenetílico del ácido cafeico inhiben la integrasa. El éster fenetílico del ácido cafeico fue el único compuesto que inhibió la etapa de integración en un grado sustancialmente mayor que la etapa inicial de escisión de la enzima. Se propone un modelo de la interacción de la 5,8-dihidroxi-1,4-naftoquinona con la región del dedo de zinc de la proteína integrasa retroviral.
Fesen et al. (Mon,) estudiaron esta cuestión.